Lomba Kompetensi Siswa atau yang biasa dikenal dengan nama LKS adalah ajang kompetensi bergengsi tahunan untuk siswa sesuai dengan bidangnya masing-masing. Tahun 2016 ini LKS Propinsi DIY diadakan mulai tanggal 2 - 6 November 2016. Dari 53 cabang yang di lombakan, SMK 2 Yogyakarta mengikuti 24 cabang lomba, yang meliputi 22 cabang Teknologi Rekayasa dan 2 cabang Seni. Ada 3 tempat lomba yang digunakan untuk cabang-cabang lomba yang diikuti oleh SMK 2 Yogyakarta, yaitu di BLPT (CNC Miling, CNC Turning, Pattern Making, Mould Making, Commercial Wiring, Software Application, Wall and Floor Tilling dan Brick Laying), UNY (Welding, Information Technology, Web Design, Mekantronika, Industrial  Control, Electronic Application, Robotic, Refrigeration, CADD Mesin, Automotive Technology, Plumbing, AutoCAD Bangunan, Joinery dan Cabinet Making) dan SMK 2 Kasihan (Animasi dan Design Graphic Technology). Untuk Animasi dan Design Graphic Technology dilaksanakan pada tanggal 2 - 4 November 2016 sedangkan untuk cabang Teknologi Rekayasa dilaksanakan pada tanggal 5 - 6 November 2016. Pada tanggal 7 November 2016 semua hasil LKS sudah diumumkan. Penutupan LKS dilaksanakan pada hari Selasa tanggal 8 November 2016 pukul 08.00 di SMK 2 Kasihan. Berikut adalah hasil yang diperoleh siswa-siswa SMK 2 Yogyakarta pada LKS 2016 :

JUARA	NAMA PESERTA	KELAS	NIS	BIDANG LOMBA
1	Ananda Mukhammad Ikhsan	XII TKJ 1	28455	Software Application
1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 3 3 3 3	Syaka Wijaya Muhammad Fatih Al Aziz Sepnu Kurniawan Hariyono Fandy Riyanto Prima Wijanarko Fajar Samudro Muhammad Dicky Fauzy Bondan Raharjo Alexander Adelni Prasetyo Negara Khoirul Saleh Bartholomeus Danar Agus Setya Fardiansyah Nur Aziz Achmad Nurcholis Diana Andriyanto Danang Margo Guntang Gumelar Miga Sukur Saputra Rohman Nur Saputra	XI TKJ 2 XI TKJ 2 XII TAV 2 XII TITPL 2 XI TKBB XII TP 2 XII TIPTL 3 XII TIPTL 1 XII TIPTL 1 XII TIPTL 2 XII TAV 1 XII TAV 1 XII TKBB XII TITPL 1 XII TKBB XII TKBB XII MM 2	29231 29221 28180 28049 28726 28237 28077 28023 28006 28063 28140 28147 27966 28031 27978 27967 28557	Information Technology Web Design Electronic Application Refrigeration Wall & Floor Tilling CADD Mesin Commercial Wiring Mekatronika 1 Industrial Control Robotik Wall & Floor Tilling Refrigeration Plumbing Brick Laying Animasi

Selamat kepada para pemenang. Semoga menjadi inspirasi untuk siswa yang lain.